bioRxiv 预印本· Li, J., Duplouy, A., Sun, L. ·· 1 天前AI 评分8
Meta2Data:面向大规模微生物组数据再分析的自动化数据处理流程
Meta2Data: Automated data processing for large scale microbiome data re-analysis
AI 导读
Meta2Data 是一个用 Python 和 Bash 实现的模块化、高度自动化流程,可从 INSDC 和 CNCB 等公共数据库按关键词或 BioProject/BioSample 编号检索微生物组测序数据。检索到的元数据经同义词词典标准化和人工审校后,流程下载原始测序数据并基于 DADA2 或 VSEARCH 标准化工作流处理,支持单靶区和多靶区数据集,输出特征表、分类学注释和系统发育树。
来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org