扰动转录组学救援排序方法学局限

2026年10月2日，一篇bioRxiv预印本指出，基于救援的转录本排序方法在扰动转录组学中可能产生误导。该研究以PLP1突变Jimpy小鼠脑（GSE277705）扰动转录组数据为例，发现原始负交互标准将47.6-76.0%的已表达基因和77.6-86.6%的疾病相关基因判为显著；在总CPM归一化下，这种过量判定主要由野生型（WT）治疗反应中位数+1.016 SD驱动，而采用median-of-ratios（MOR）归一化后该数值降至+0.154 SD。研究将问题归因于归一化位移与共享对照耦合。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。