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EcoNet深度学习框架提升免疫治疗反应预测

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AI 综述

2026年10月13日,bioRxiv发布预印本研究,研究者提出深度学习计算框架EcoNet,用于分析肿瘤微环境并预测免疫治疗应答。该框架先建模由共现细胞状态组成的生态系统,再构建细胞间与细胞内信号网络,并利用图注意力网络提取嵌入进行预测。研究在2,532例泛癌免疫治疗样本上预训练,结果显示EcoNet的AUC较现有预测方法提升7.5-19.9%,较基于标志物的signature提升4.4-21.2%;经ccRCC疾病特异性微调后,可在独立ccRCC队列中按临床结局分层(P=0.024)。目前该研究为预印本,尚未经同行评审。

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报道时间线

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10月13日
  1. bioRxiv 预印本
    EcoNet:深度学习驱动的肿瘤微环境图谱提升免疫治疗应答预测

    研究者提出计算框架EcoNet,先建模共现细胞状态组成的生态系统,再构建细胞间与细胞内信号网络,并用图注意力网络提取嵌入以预测免疫治疗应答。在2,532例泛癌免疫治疗样本上预训练后,EcoNet的AUC较现有预测方法提升7.5-19.9%,较基于标志物的signature提升4.4-21.2%;经ccRCC疾病特异性微调后,可在独立ccRCC队列中按临床结局分层(P=0.024)。

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