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CloneTrast从单细胞转录组推断T细胞克隆结构
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AI 综述
2026年10月14日,bioRxiv发布预印本,研究者提出CloneTrast,一种监督对比学习框架。该框架训练时利用配对scRNA/TCR-seq数据,推理时仅需scRNA-seq即可从基因表达推断T细胞克隆-功能状态。基于16种癌症类型、260万个人类T细胞的配对数据,该方法识别出TCR序列相似性或常规细胞状态注释无法解释的T细胞克隆生态位,其中一个富集肿瘤-血液共享TCR的NK样T细胞生态位在泛癌层面与免疫治疗应答不良相关。
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最新进展10月14日 08:00
CloneTrast预印本发布,可从scRNA-seq推断T细胞克隆-功能状态。报道时间线
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10月14日
- bioRxiv 预印本CloneTrast:基于对比学习从单细胞RNA测序揭示泛癌T细胞克隆生态位
研究者提出CloneTrast,一种监督对比学习框架,训练时利用配对scRNA/TCR-seq数据,推理时仅需scRNA-seq即可从基因表达推断T细胞克隆-功能状态。基于16种癌症类型、260万个人类T细胞的配对数据,该方法识别出TCR序列相似性或常规细胞状态注释无法解释的T细胞克隆生态位,其中一个富集肿瘤-血液共享TCR的NK样T细胞生态位在泛癌层面与免疫治疗应答不良相关。
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