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蛋白语言模型条件化GNN预测GPCR配体活性

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AI 综述

2026年10月7日,bioRxiv发布预印本,研究者开发了一种多模态图神经网络,将配体分子图与冻结的蛋白语言模型GPCR序列表征结合,用于同时预测pActivity定量值与二分类活性。该模型在271,739个配体–GPCR配对上训练,覆盖183,694个配体和216个人源GPCR。采用ESM-2 650M受体嵌入时,在随机、冷配体和骨架划分下的平均绝对误差分别为0.513、0.540和0.641个pActivity单位。目前该工作处于预印本阶段,尚未见后续报道。

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报道时间线

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10月7日
  1. bioRxiv 预印本
    蛋白语言模型条件化图神经网络用于GPCR配体活性多任务预测

    研究者开发了一种多模态图神经网络,将配体分子图与冻结的蛋白语言模型GPCR序列表征结合,同时预测pActivity定量值与二分类活性。模型在271,739个配体–GPCR配对上训练,覆盖183,694个配体和216个人源GPCR;采用ESM-2 650M受体嵌入时,随机、冷配体和骨架划分下的平均绝对误差分别为0.513、0.540和0.641个pActivity单位。

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