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预印本质疑PPI预测基准Guo酵母数据集评估方法
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AI 综述
2026年10月14日，一篇bioRxiv预印本对Guo酵母基准数据集提出重新评估，指出蛋白质新颖性、序列相似性与负采样控制会影响PPI预测的基准特异性判别。该预印本报告，AAC+CTD-MLP的ROC-AUC在seen-seen配对上为0.697，one-unseen降至0.626，both-unseen降至0.587；在50%、40%、30%、20% MMseqs2聚类阈值下独立重建的R3变体表现无一致单调趋势。目前该工作仍为预印本，尚未见同行评议或后续报道。
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最新进展10月14日 08:00
预印本报告Guo酵母基准重评结果：AAC+CTD-MLP的ROC-AUC随未见配对数增加而下降。报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月14日
- bioRxiv 预印本蛋白质新颖性、序列相似性与负采样控制揭示 PPI 预测基准特异性判别
对 Guo 酵母基准的重新评估显示，AAC+CTD-MLP 的 ROC-AUC 在 seen-seen 配对上为 0.697，one-unseen 降至 0.626，both-unseen 降至 0.587；在 50%、40%、30%、20% MMseqs2 聚类阈值下独立重建的 R3 变体表现无一致单调趋势。
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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。