bioRxiv 预印本· Young, J., Aryal, S., Nelson, D., Raya, D., Gnimpieba Z., E. A., Zhou, R. ·· 1 天前AI 评分12
基于426个蓝藻组装体预测蓝藻有氧固氮潜力并优先筛选Nif之外的候选蛋白家族
Predicting cyanobacterial oxic diazotrophy and prioritizing candidate protein families beyond known Nif proteins
AI 导读
研究以nifHDK定义固氮潜力，对426个蓝藻组装体做蛋白家族存在/缺失建模，四种分类器属级阻断交叉验证平均ROC AUC为0.853至0.893；限定401个具NCBI当前状态的组装体后AUC为0.806至0.881。研究给出两份候选清单：981个高纯度家族与473个正残差关联家族，并通过结合蛋白组学、凝聚体驱动排名和属级形态型代理的启发式评分，优先选出167个家族供实验验证。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org