medRxiv 预印本· Ortega, Y., Gupta, P., Olinares-Perdomo, O., Oakeson, K. F., Young, E. L. ·· 1 天前AI 评分12
SARS-CoV-2 扩增子测序数据缩减:Read Subsampling 与 Normalization 对共识质量、谱系判定及计算负担的影响
Data Reduction in SARS-CoV-2 Amplicon Sequencing: Effects of Read Subsampling and Normalization on Consensus Quality, Lineage Assignment, and Computational Burden
AI 导读
研究在 220 份 SARS-CoV-2 临床标本和 12 份污水样本上评估 SeqKit 随机降采样与 BBNorm 测序深度归一化两种数据缩减策略,将 FASTQ 降至 10X 至 10,000X 目标深度。
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