墨西哥丽脂鲤洞穴种群演化出新型宿主-肠道菌群耦合以适应营养匮乏环境

墨西哥丽脂鲤（Astyanax mexicanus）地表与洞穴种群对肠道菌群的调控方式截然不同，洞穴鱼招募的微生物其预测代谢物可在营养受限条件下特异性促进生长。基于三种饮食方案与禁食处理的菌群数据，拓扑数据分析与稀疏建模识别出与洞穴鱼生长耦合的糖和脂肪酸降解通路，这些通路的代谢物仅对洞穴鱼生长有益。禁食使洞穴鱼招募能代谢宿主无法利用的芳香化合物的肠道微生物，而地表鱼招募的微生物关联极少。