bioRxiv 预印本· Oualline, G., Pandey, S., Zhang, X. B., Boucher, C. A., Yu, Y. W. ·· 1 天前AI 评分10
alamem:基于MEM链式差异估计的近似局部比对工具,用于检测水平基因转移
Approximate local alignment via chained MEM divergence estimation for detecting horizontal gene transfer
AI 导读
研究人员发布近似局部比对工具alamem,通过MEM链式统计估算ANI,可在30秒内用4 GB内存将细菌基因组比对至超过85,000个原核基因组,速度与内存效率分别达现有局部比对工具默认模式的16倍和21倍。
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