基于占位变化模型分析推断酵母转录预起始复合物组装路径

研究开发了一套定量框架，通过微分方程模型与惩罚准则参数优化，对候选PIC组装路径进行打分，以解释酵母Mediator突变体（Med17和Med10亚基）的ChIP-seq占位变化。结果显示，最佳支持的PIC组装路径与体外推断不同，需区分核心TFIIH模块与TFIIK激酶模块，且以Mediator或TBP起始的相似路径获得的支持程度不同。组装路径可能因基因而异，同一基因在体内也可能存在多条并行路径。