bioRxiv 预印本· Meng, L., Zhu, J., Han, B., Zang, Y., Li, W., Zong, K., Zhong, J., Yang, Y., Liu, J., Jia, J., Sun, R., Yu, G., Han, J., Chen, Y., Zhang, L., Xu, J. ·· 10 小时前AI 评分18
BioMod:面向单细胞基础建模的生物学模块Token化方法
BioMod: Biological Module Tokenization for Single-Cell Foundation Modeling
AI 导读
BioMod 是一个 5000 万参数的单细胞基础模型,以 660 个源自通路与数据驱动基因程序的生物学模块作为基因与细胞之间的表征单元,替代数千个基因级输入。该模型在约 7300 万个人类细胞上预训练,采用高比例模块掩码与非对称解码器,在细胞类型注释、零样本批次整合、扰动响应预测和药物响应预测上达到 state-of-the-art,并可在单张 GPU 上高效推理。
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