arXiv 定量生物学· Xichen Sun, Wentao Wei, Xiaoxi Zhang, Yuedong Yang, Jiahua Rao·· 4 小时前AI 评分12
PepTIDE：多尺度时间流框架用于肽轨迹生成
Multi-Scale Temporal Flows for Peptide Trajectory Generation
AI 导读
PepTIDE 是一个多尺度时间框架，用于生成肽的分子动力学轨迹。其训练窗口步长从连续区间采样，并通过自适应物理时间嵌入编码窗口相对间隔与每帧绝对时间，使共享速度场具备间隔感知能力；所有帧经随机插值流联合生成，配对感知不变点注意力捕捉线性与环肽的几何和拓扑。在 PepMD 及 50 个环肽基准系统上，PepTIDE 达到最优分布一致性与结构有效性，并能恢复稀疏跃迁帧、更忠实再现态间通量。
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