bioRxiv 预印本· Treit, P. V., Rosenberger, F. A., Hartout, P., Lebedev, M., Xiao, J., Zwiebel, M., Geyer, P. E., Sinha, A., Wallmann, G., Brennsteiner, V., Korff, K., Rodriguez, E. H., Zeng, W.-F., Strauss, M. T., Keller, M. I., Kuhn, M., Trebicka, J., Junot, C., Arumugam, M., Grembi, J. A., Shalon, D., Huang, K. C., Borgwardt, K., Mueller-Reif, J. B., Mann, M. ·· 1 天前AI 评分22
FastaLake 利用 de novo 肽段预测从大型序列库中筛选紧凑宏蛋白质组数据库
FastaLake selects compact metaproteomic databases from large sequence reservoirs by de novo peptide lookup
AI 导读
FastaLake 是一种计算流程，利用 AlphaNovo 的全长 de novo 肽段预测从广泛序列资源中检索完整蛋白质，构建紧凑数据库用于常规搜索。在八成员定义群落中，FastaLake 无需已知成员即可接近参考搜索的肽段产出；在两组粪便队列中鉴定肽段数与匹配宏基因组数据库相当，肠液中多出 20-35%（1% 肽段 FDR）。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org