利用鸟枪法宏基因组宿主读段检测线粒体异质性

印度Nagpur 47份健康成人上呼吸道拭子鸟枪法宏基因组数据显示，宿主读段可完整回收线粒体基因组（平均深度433X，范围9-3,029X），并在47份样本中的46份完成宏单倍群分型。异质性检测在等位基因分数>5%时有效，5%阈值下T>A调用消失、Ti/Tv升至2.20；低于该阈值时，NUMT去除后仍存在以T>A为主的错误过程，背景拟合模型无法捕捉。