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原文
bioRxiv 预印本· Zanussi, J. T., Miles, C. E. ·· 1 天前AI 评分8

自适应minibatch方法提升大规模异质生物数据的SMC ABC推断效率

Efficient approximate Bayesian inference for large, heterogeneous biological datasets

AI 导读

针对大规模异质生物数据中SMC ABC因需对每个观测单独模拟而成本过高的问题,研究者提出一种自适应minibatch方法:早期探索用小批量、随后验精化逐步增大批量,批量大小由目标精度设定且不随数据集规模增长。在合成生物模型和真实单细胞基因表达数据(异质性涵盖细胞几何与初始条件)上,该方法以远低于全数据SMC ABC的成本获得接近的后验。

来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org