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自适应minibatch提升SMC ABC推断效率
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AI 综述
2026年10月12日,bioRxiv发布预印本,针对大规模异质生物数据中SMC ABC因需对每个观测单独模拟而成本过高的问题,研究者提出一种自适应minibatch方法:早期探索用小批量,随后验精化逐步增大批量,批量大小由目标精度设定且不随数据集规模增长。在合成生物模型和真实单细胞基因表达数据(异质性涵盖细胞几何与初始条件)上,该方法以远低于全数据SMC ABC的成本获得接近的后验。
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最新进展10月12日 08:00
bioRxiv预印本提出自适应minibatch方法,显著降低SMC ABC推断成本。报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月12日
- bioRxiv 预印本自适应minibatch方法提升大规模异质生物数据的SMC ABC推断效率
针对大规模异质生物数据中SMC ABC因需对每个观测单独模拟而成本过高的问题,研究者提出一种自适应minibatch方法:早期探索用小批量、随后验精化逐步增大批量,批量大小由目标精度设定且不随数据集规模增长。在合成生物模型和真实单细胞基因表达数据(异质性涵盖细胞几何与初始条件)上,该方法以远低于全数据SMC ABC的成本获得接近的后验。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。