bioRxiv 预印本· McConnell, U., Nonchev, K., Koelzer, V. H., Raetsch, G. ·· 1 天前AI 评分12
组织学引导监督无法提升转录组基础模型的跨供体注释迁移
Slide-level batch structure limits histology-guided supervision of transcriptomic foundation models
AI 导读
在三个转录组基础模型上,匹配的H&E组织学作为训练期监督信号未能带来跨供体注释迁移的一致整体改善,尽管仅用组织学的迁移效果明显更强。基于spot的空间转录组基因表达嵌入维度低且受切片身份强烈结构化,限制了可用于跨模态迁移的共享基因—形态学信号。该监督对部分形态学独特类别有益,但广泛降低了全转录组的留出基因预测能力。
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