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RiboFlow v2：可配置核糖体图谱分析流程揭示测量结果对读段比对方法的敏感性
RiboFlow v2: a configurable ribosome profiling pipeline reveals measurements sensitive to read-mapping methodology
AI 导读
研究人员在原有转录组流程基础上开发了RiboFlow v2，新增基因组比对与多比对读段的可配置处理功能。基于24个人核糖体图谱文库及配对RNA-seq数据，在严格比对过滤条件下，匹配编码序列位置的核苷酸水平覆盖度与翻译效率（TE）在两种比对策略间总体一致，但个别基因的覆盖度和TE估计存在显著差异，涉及参考转录本缺失的可变外显子覆盖及蛋白编码基因与加工假基因间的模糊比对。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org