arXiv 定量生物学· Aaron L. Feller, Kris Deibler, Maxim Secor·· 17 小时前AI 评分17
EnsembleEGNN：基于集合的图学习用于环肽热力学系综
EnsembleEGNN: Set-Based Graph Learning for Thermodynamic Ensembles of Cyclic Peptides
AI 导读
EnsembleEGNN 通过共享等变图神经网络层处理单个构象并用集合注意力池化，从整个系综预测分子性质，在 CREMP 环肽数据集上以多任务自监督预训练。在 CycPeptMPDB 膜渗透性基准上，随机交叉验证 R² 达 0.477，优于纯序列 BERT 基线（R²=0.439）；Butina 分布外拆分下为 0.401 对 0.354。
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