bioRxiv 预印本· Otto, D. J., Baasri, S., Setty, M. ·· 1 天前AI 评分12
AnnZarro:单细胞数据中细胞间与基因间关系的可扩展交互式探索工具
AnnZarro: scalable, interactive exploration of cell-by-cell and gene-by-gene relationships in single-cell data
AI 导读
AnnZarro 是一款点选式浏览器查看器,可将细胞间与基因间关系矩阵与 AnnData 对象的细胞×基因数据联动展示,无需编程即可探索。它仅从 zarr 存储读取各面板所需的矩阵行列,使笔记本或共享服务器能处理远超内存的数据集:在笔记本上,Tahoe-100M 的 10 万细胞子集 4 秒打开并保持交互,关闭子集后可在约 5 至 7 秒内绘制全部 9560 万个细胞。
来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org