bioRxiv 预印本· Tran, L. T. H., Nguyen, V. T. ·· 1 天前AI 评分20
单细胞扰动筛选需要多少细胞才能确定扰动方向?一种闭式、考虑对照的细胞配额
How many cells resolve a perturbation direction? A closed-form, control-aware cell quota for single-cell perturbation screens
AI 导读
研究推导出单细胞扰动筛选的闭式各向异性细胞配额,用于将扰动方向估计的角度误差控制在设定容差内,该配额取决于垂直于效应的噪声、效应幅度和对照池大小,并在对照设定的幅度下限以下发散。在四个公共图谱(六个筛选)中,每细胞噪声方差在化学和全基因组遗传平台上接近1.0;在Tahoe-100M上以约3,100细胞的DMSO对照为参照,56,827个条件中55%受对照池限制,仅11%在5.7度容差下被过度采样。
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