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IdeR 通过施加应力区分非 cognate DNA 序列
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AI 综述
2026年10月6日，bioRxiv 发布一项预印本研究，探讨结核分枝杆菌等革兰阳性菌铁代谢调控因子 IdeR 区分非 cognate DNA 序列的机制。研究指出，IdeR 通过间接或形状读取识别靶 DNA，而非直接碱基互作。研究结合分子动力学模拟、X 射线晶体学与 DNA 结合实验，发现 IdeR 识别螺旋形成差异化介电裂隙，以极性口袋容纳 5'-C1C2 前两位碱基、非极性口袋容纳第三位 T；局部介电环境对非 cognate DNA 施加应力，导致非生产性结合，从而保证靶序列读取保真度。目前该研究为预印本，尚无后续报道。
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最新进展10月6日 08:00
bioRxiv 预印本提出 IdeR 通过介电裂隙施加应力区分非 cognate DNA。报道时间线
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10月6日
- bioRxiv 预印本IdeR 通过施加应力区分非 cognate DNA 序列的机制研究
结核分枝杆菌等革兰阳性菌的铁代谢调控因子 IdeR 通过间接或形状读取识别靶 DNA，而非直接碱基互作。研究结合分子动力学模拟、X 射线晶体学与 DNA 结合实验发现，IdeR 识别螺旋形成差异化介电裂隙，以极性口袋容纳 5'-C1C2 前两位碱基、非极性口袋容纳第三位 T，局部介电环境对非 cognate DNA 施加应力导致非生产性结合，从而保证靶序列读取保真度。
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