bioRxiv 预印本· Ghosh, S., Koshla, O., Maurer, D., Tieleman, S., Aqvist, J., Griese, J. J., Satpati, P. ·· 19 小时前AI 评分12
IdeR 通过施加应力区分非 cognate DNA 序列的机制研究
The bacterial iron sensor IdeR distinguishes DNA sequences by applying stress to non-cognate DNA
AI 导读
结核分枝杆菌等革兰阳性菌的铁代谢调控因子 IdeR 通过间接或形状读取识别靶 DNA，而非直接碱基互作。研究结合分子动力学模拟、X 射线晶体学与 DNA 结合实验发现，IdeR 识别螺旋形成差异化介电裂隙，以极性口袋容纳 5'-C1C2 前两位碱基、非极性口袋容纳第三位 T，局部介电环境对非 cognate DNA 施加应力导致非生产性结合，从而保证靶序列读取保真度。
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