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高通量鉴定染色质开放转录因子
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AI 综述
2026年10月9日,bioRxiv发布预印本,报告对小鼠胚胎干细胞中240个发育相关转录因子进行pooled CRISPRa筛选,并选取其中60个在约14万个单细胞中联合分析基因表达与染色质可及性。研究发现,部分转录因子(如Cdx2、Sox10)可自主开启新的染色质可及位点,另一些则依赖共转录因子或层级激活(如Sox7→Gata6)。结果表明,新表达转录因子开放染色质的能力取决于其所在细胞类型、状态及基因调控网络。
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最新进展10月9日 08:00
bioRxiv预印本报告240个发育相关TF的CRISPRa筛选及60个TF的单细胞联合分析结果。报道时间线
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10月9日
- bioRxiv 预印本高通量鉴定染色质开放转录因子:CRISPRa 筛选240个发育相关TF
研究对小鼠胚胎干细胞中240个发育相关转录因子进行pooled CRISPRa筛选,选取60个在约14万个单细胞中联合分析基因表达与染色质可及性。部分TF(如Cdx2、Sox10)可自主开启新可及位点,另一些则依赖共TF或层级激活(如Sox7→Gata6)。结果表明新表达TF开放染色质的能力取决于其所在细胞类型、状态及基因调控网络。
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