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原文
bioRxiv 预印本· Keith, A., Jain, S., Daza, R. M., Qiu, C., Germain, P.-L., Shendure, J., Domcke, S. ·· 18 小时前AI 评分22

高通量鉴定染色质开放转录因子:CRISPRa 筛选240个发育相关TF

High-throughput identification of chromatin-opening transcription factors

AI 导读

研究对小鼠胚胎干细胞中240个发育相关转录因子进行pooled CRISPRa筛选,选取60个在约14万个单细胞中联合分析基因表达与染色质可及性。部分TF(如Cdx2、Sox10)可自主开启新可及位点,另一些则依赖共TF或层级激活(如Sox7→Gata6)。结果表明新表达TF开放染色质的能力取决于其所在细胞类型、状态及基因调控网络。

来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org