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DECONVersation:单细胞基础模型嵌入用于bulk RNA-seq解卷积

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AI 综述

2026年10月9日,bioRxiv发布预印本,研究者提出DECONVersation方法,利用预训练及微调的单细胞基础模型嵌入,结合非负最小二乘求解器,从bulk RNA-seq中估计细胞类型比例,无需显式筛选标记基因。报道称,与MuSiC、DWLS和BayesPrism相比,DECONVersation在多种组织中表现相当或更优,且经组织特异性微调后性能进一步提升。目前该研究处于预印本阶段,尚未见同行评议或后续报道。

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报道时间线

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10月9日
  1. bioRxiv 预印本
    DECONVersation:基于单细胞基础模型嵌入的 bulk RNA-seq 稳健细胞类型解卷积

    研究者提出 DECONVersation,利用预训练及微调的单细胞基础模型嵌入结合非负最小二乘求解器,从 bulk RNA-seq 中估计细胞类型比例,无需显式筛选标记基因。与 MuSiC、DWLS 和 BayesPrism 相比,DECONVersation 在多种组织中表现相当或更优,且经组织特异性微调后性能进一步提升。

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