bioRxiv 预印本· Oku, A., Geiger, H., Robine, N., Fu, R. ·· 21 小时前AI 评分17
DECONVersation：基于单细胞基础模型嵌入的 bulk RNA-seq 稳健细胞类型解卷积
DECONVersation: Single Cell Foundation Model-Derived Embeddings for Robust Cell Type Deconvolution of Bulk RNA-seq
AI 导读
研究者提出 DECONVersation，利用预训练及微调的单细胞基础模型嵌入结合非负最小二乘求解器，从 bulk RNA-seq 中估计细胞类型比例，无需显式筛选标记基因。与 MuSiC、DWLS 和 BayesPrism 相比，DECONVersation 在多种组织中表现相当或更优，且经组织特异性微调后性能进一步提升。
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