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Swap-seq方法系统绘制增强子沉默子图谱

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AI 综述

2026年10月9日,bioRxiv发布预印本报道,研究人员开发了Swap-seq方法,将pooled twin prime editing与流式分选结合,可删除数百个内源调控序列并定量测量其对邻近基因表达的影响。研究在THP-1单核细胞中应用于PPIF表达调控解析,量化了远端和内含子增强子效应,表征了CTCF绝缘子,并发现一个通过HDAC介导抑制邻近增强子来调控远端基因的沉默子。目前该研究处于预印本阶段,尚未见后续报道。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月9日
  1. bioRxiv 预印本
    利用prime editing删除筛选系统性绘制增强子、沉默子与拓扑元件图谱

    研究人员开发了Swap-seq方法,将pooled twin prime editing与流式分选结合,可删除数百个内源调控序列并定量测量其对邻近基因表达的影响。在THP-1单核细胞中应用于PPIF表达调控解析,量化了远端和内含子增强子效应,表征了CTCF绝缘子,并发现一个通过HDAC介导抑制邻近增强子来调控远端基因的沉默子。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。