bioRxiv 预印本· Cai, X. S., Montgomery, M. T., Nagano, M., Nisal, A., Gu, Z., Chen, Z., Obbad, K., Rastogi, R., Tan, Y., Zeng, T., Sheth, M. U., Xia, C., Chiang, S., Kundaje, A., Hansen, A. S., Bintu, L., Engreitz, J. M. ·· 20 小时前AI 评分22
利用prime editing删除筛选系统性绘制增强子、沉默子与拓扑元件图谱
Systematic mapping of enhancers, silencers, and topological elements with prime editing deletion screens
AI 导读
研究人员开发了Swap-seq方法，将pooled twin prime editing与流式分选结合，可删除数百个内源调控序列并定量测量其对邻近基因表达的影响。在THP-1单核细胞中应用于PPIF表达调控解析，量化了远端和内含子增强子效应，表征了CTCF绝缘子，并发现一个通过HDAC介导抑制邻近增强子来调控远端基因的沉默子。
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