DeSPA空间转录组分析框架发布

2026年10月11日，bioRxiv发布预印本，介绍统计框架DeSPA，用于跨多切片空间转录组图谱检测基因空间模式重塑与协同空间程序。该框架通过线性混合模型建模各切片内基因特异性空间变异，聚合重复切片证据检验跨状态重塑，并将识别出的基因组织为可解释的空间共表达模块。模拟显示其在切片间异质性下兼具高检验效能与错误发现率控制；在小鼠胚胎发育、糖尿病睾丸、蝾螈脑再生及两种小鼠脑出血模型中均解析出协同空间程序。目前进展为预印本发布。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。