bioRxiv 预印本· Wen, H., Shen, Q., Yuan, Z., Zhang, S. ·· 1 天前AI 评分20
DeSPA：跨多切片空间转录组图谱检测基因空间模式重塑与协同空间程序
DeSPA uncovers genes with cross-state spatial pattern remodeling and coordinated spatial programs across multi-slice spatial transcriptomics atlases
AI 导读
DeSPA 是一个统计框架，通过线性混合模型建模各切片内基因特异性空间变异，聚合重复切片证据检验跨状态重塑，并将识别出的基因组织为可解释的空间共表达模块。模拟显示其在切片间异质性下兼具高检验效能与错误发现率控制；在小鼠胚胎发育、糖尿病睾丸、蝾螈脑再生及两种小鼠脑出血模型中均解析出协同空间程序。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org