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SORT框架解析空间转录组多层次基因程序

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AI 综述

2026年10月11日,bioRxiv发布预印本,研究人员提出矩阵分解框架SORT,用于解构异质性空间转录组图谱中的多层次基因程序。该框架可联合恢复多层次基因表达程序(GEP)及其空间活动,利用正交性减少程序冗余、图全变差保留空间边界。在患者变异强的模拟中,SORT比现有方法更准确恢复患者特异性、亚型共享及区域相关程序。在108例胰腺导管腺癌切片中,SORT解析出肿瘤与基质程序并关联四个外部队列的生存数据;跨物种小脑图谱中区分保守层相关程序与物种特异性活动差异。

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报道时间线

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10月11日
  1. bioRxiv 预印本
    SORT 解构异质性空间转录组图谱中的多层次基因程序

    研究人员提出矩阵分解框架 SORT,可联合恢复多层次基因表达程序(GEP)及其空间活动,利用正交性减少程序冗余、图全变差保留空间边界。在患者变异强的模拟中,SORT 比现有方法更准确恢复患者特异性、亚型共享及区域相关程序。在 108 例胰腺导管腺癌切片中,SORT 解析出肿瘤与基质程序并关联四个外部队列的生存数据;跨物种小脑图谱中区分保守层相关程序与物种特异性活动差异。

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