SORT 解构异质性空间转录组图谱中的多层次基因程序

研究人员提出矩阵分解框架 SORT，可联合恢复多层次基因表达程序（GEP）及其空间活动，利用正交性减少程序冗余、图全变差保留空间边界。在患者变异强的模拟中，SORT 比现有方法更准确恢复患者特异性、亚型共享及区域相关程序。在 108 例胰腺导管腺癌切片中，SORT 解析出肿瘤与基质程序并关联四个外部队列的生存数据；跨物种小脑图谱中区分保守层相关程序与物种特异性活动差异。