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methylTFR工具从DNA甲基化量化转录因子活性
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AI 综述
2026年10月5日,bioRxiv发布预印本,研究人员开发了R包methylTFR,可从DNA甲基化数据量化转录因子(TF)结合位点的活性,输出低维、可解释的活性谱。在147份人类免疫细胞甲基化组中,methylTFR识别出细胞类型特异性调控因子,包括髓系细胞中的CEBP和ETS家族活性;在CD4+ T细胞中,TF活性评分可解析初始到记忆的轨迹,并提示AP-1因子是重要的记忆调控因子。
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最新进展10月5日 08:00
bioRxiv预印本发布methylTFR,可从DNA甲基化量化转录因子活性。报道时间线
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10月5日
- bioRxiv 预印本methylTFR:从 DNA 甲基化计算量化转录因子活性
研究人员开发了 R 包 methylTFR,可从 DNA 甲基化数据量化转录因子(TF)结合位点的活性,输出低维、可解释的活性谱。在 147 份人类免疫细胞甲基化组中,methylTFR 识别出细胞类型特异性调控因子,包括髓系细胞中的 CEBP 和 ETS 家族活性;在 CD4+ T 细胞中,TF 活性评分可解析初始到记忆的轨迹,并提示 AP-1 因子是重要的记忆调控因子。
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