bioRxiv 预印本· Gunduz, I. B., Nitsch, R., Murugan, S. K., Mueller, F. ·· 21 小时前AI 评分12
methylTFR:从 DNA 甲基化计算量化转录因子活性
methylTFR: Computational quantification of transcription factor activity from DNA methylation
AI 导读
研究人员开发了 R 包 methylTFR,可从 DNA 甲基化数据量化转录因子(TF)结合位点的活性,输出低维、可解释的活性谱。在 147 份人类免疫细胞甲基化组中,methylTFR 识别出细胞类型特异性调控因子,包括髓系细胞中的 CEBP 和 ETS 家族活性;在 CD4+ T 细胞中,TF 活性评分可解析初始到记忆的轨迹,并提示 AP-1 因子是重要的记忆调控因子。
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