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EXCON:基于CAFE的基因家族扩张收缩分析Nextflow流程

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AI 综述

2026年10月1日,bioRxiv发布预印本报道,Eco-Flow 社区开发了自动化 Nextflow 流程 EXCON,用于基于 CAFE 的基因扩张与收缩分析。该流程整合了 NCBI 基因组下载、Orthofinder 直系同源基因家族鉴定、CAFE 出生-死亡建模与 GO 富集分析,可自动选择 CAFE lambda 和误差模型,并支持本地、HPC 与云计算环境。目前该流程以预印本形式发布,尚未见后续进展报道。

AI 根据报道生成 · 4 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月1日
  1. bioRxiv 预印本
    EXCON:用于基于 CAFE 的基因扩张与收缩分析的可扩展、可复现 Nextflow 流程

    Eco-Flow 社区开发的自动化 Nextflow 流程 EXCON 整合了 NCBI 基因组下载、Orthofinder 直系同源基因家族鉴定、CAFE 出生-死亡建模与 GO 富集分析,可自动选择 CAFE lambda 和误差模型,并支持本地、HPC 与云计算环境。

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