bioRxiv 预印本· Wyatt, C. D. R., Duarte, F., Cerqueira De Araujo, A., Murray, S., Oi, C., Sumner, S. ·· 21 小时前AI 评分12
EXCON：用于基于 CAFE 的基因扩张与收缩分析的可扩展、可复现 Nextflow 流程
EXCON: a scalable, reproducible Nextflow pipeline for CAFE-based gene EXpansion and CONtraction analysis
AI 导读
Eco-Flow 社区开发的自动化 Nextflow 流程 EXCON 整合了 NCBI 基因组下载、Orthofinder 直系同源基因家族鉴定、CAFE 出生-死亡建模与 GO 富集分析，可自动选择 CAFE lambda 和误差模型，并支持本地、HPC 与云计算环境。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org