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HyperCom:超图推断单细胞通讯方法
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AI 综述
2026年10月8日,bioRxiv发布预印本,研究人员开发了HyperCom,一种基于超图的方法,可从单细胞转录组数据推断细胞分辨率的细胞间通讯。该方法利用已知配体-受体相互作用及单个细胞中的表达构建超图,通过图扩散对每个LR对在发送者到接收者连续谱上为细胞打分,并生成不依赖细胞类型注释的LR对排序。HyperCom在物理细胞接触、空间和多条件数据集上得到验证,以物种无关、可扩展的开源R包形式提供。
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最新进展10月8日 08:00
HyperCom预印本发布,以开源R包形式提供。报道时间线
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10月8日
- bioRxiv 预印本HyperCom:基于超图推断单细胞分辨率细胞间通讯的方法
研究人员开发了HyperCom,一种基于超图的方法,可从单细胞转录组数据推断细胞分辨率的细胞间通讯。该方法利用已知配体-受体相互作用及单个细胞中的表达构建超图,通过图扩散对每个LR对在发送者到接收者连续谱上为细胞打分,并生成不依赖细胞类型注释的LR对排序。HyperCom在物理细胞接触、空间和多条件数据集上得到验证,以物种无关、可扩展的开源R包形式提供。
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