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原文
bioRxiv 预印本· Moy, J. K., Przytycki, P. F. ·· 14 小时前AI 评分12

HyperCom:基于超图推断单细胞分辨率细胞间通讯的方法

HyperCom: a hypergraph-based method to infer cell-resolved cell-cell communication

AI 导读

研究人员开发了HyperCom,一种基于超图的方法,可从单细胞转录组数据推断细胞分辨率的细胞间通讯。该方法利用已知配体-受体相互作用及单个细胞中的表达构建超图,通过图扩散对每个LR对在发送者到接收者连续谱上为细胞打分,并生成不依赖细胞类型注释的LR对排序。HyperCom在物理细胞接触、空间和多条件数据集上得到验证,以物种无关、可扩展的开源R包形式提供。

来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org