bioRxiv 预印本· Carcanholo, F. P., Cassiano, M. H. A., Panepucci, E. M., Laurini, M. P., Malta, T. M. ·· 14 小时前AI 评分18
CosMx 胶质瘤数据点过程建模：从 scRNA-seq 推断肿瘤空间结构
Point-Process Modelling of Cell-Type Interaction Structure in CosMx Glioma Data for Hypothesis-Driven Tumor Inference from scRNA-seq
AI 导读
研究基于 CosMx 数据构建空间统计框架，分析 8 例 GBM 样本的 2,427,362 个细胞、15 个细胞群体和 4 种恶性状态，以 Log-Gaussian Cox Process 建模全组织空间强度。巨噬细胞、小胶质细胞、单核细胞、cDCs、中性粒细胞和 T 细胞等免疫群体对恶性状态表现出空间吸引。转录本丰度预测空间表型的表现优于代谢通路评分，但留一患者验证显示跨患者迁移性有限。
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