通过配体依赖性突变预测评估大语言模型的物理直觉

一项预印本研究用同一蛋白同一替换在不同结合配体下的基准，评估大语言模型能否仅凭局部原子坐标推断突变效应。表现最佳的LLM分组准确率与所评估的能量预测器及LLM驱动工具流程Biomni相当，但预测模式存在差异；多数模型在亲和力提升较大时分组准确率更高。结构干预支持模型对突变位点和配体信息的选择性依赖。