跳到正文
原文
bioRxiv 预印本· Teschendorff, A., Tong, H., Guo, X. ·· 1 天前AI 评分20

基于DNA甲基化的细胞类型分辨率分化状态预测工具EpiDiff揭示衰老相关表观遗传间充质漂移

DNA methylation-based prediction of differentiation state at cell-type resolution reveals an age-associated epigenetic mesenchymal drift

AI 导读

研究者利用机器学习构建了DNA甲基化分化状态预测工具EpiDiff,可输出连续的绝对分化指数(DI),并在单细胞、分选细胞、bulk组织及体外分化、类器官、重编程和细胞年轻化实验中完成验证。在分选细胞群中,DI随年龄升高,多种细胞类型出现发育性表观遗传漂移,以向间充质谱系漂移最为显著。应用于正常组织时,EpiDiff可预测致癌物暴露与癌症风险。

来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org