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原文
bioRxiv 预印本· Giustolisi, A., Avenel, C., Wählby, C. ·· 23 小时前AI 评分12

SFUMATO:面向空间转录组学的贝叶斯概率聚类与不确定性可视化框架

SFUMATO: Bayesian probabilistic clustering for uncertainty-aware spatialtranscriptomics analysis and mapping

AI 导读

SFUMATO 是一个 GPU 加速的贝叶斯概率聚类与可视化框架,基于无分割多尺度转录本分箱和贝叶斯高斯混合模型,推断每个空间位置的转录组组分后验概率。在 10x Genomics Xenium 小鼠脑和人乳腺癌公开数据集上,SFUMATO 无需预先细胞分割即可恢复细胞相关空间组织,其乳腺癌后验图可转换为与病理区域一致的语义掩膜,并突出 DCIS 相关组织的异质性。

来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org