bioRxiv 预印本· Costa, J., van der Steen, B. A., Mulla, Y. ·· 1 天前AI 评分12
通过追踪噬菌斑扩展动态进行噬菌体表型分析
Phage phenotyping by measuring plaque expansion dynamics
AI 导读
研究者开发了一种用消费级平板扫描仪和开源计算机视觉软件连续追踪噬菌斑扩展的低成本可扩展方法,并通过对BASEL大肠杆菌噬菌体集合拟合五参数模型,捕捉到各细菌生长阶段的噬菌斑扩展动态。噬菌斑初始扩展速率与病毒基因组大小呈负相关,且与液体培养中的细菌崩溃时间不相关;仅凭动态噬菌斑参数即可用随机森林分类器以72.1%准确率预测噬菌体分类科,而传统终点噬菌斑大小无预测能力。
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