bioRxiv 预印本· Liang, Y., Xu, X., Mao, Y., Zheng, Z., Liu, N. ·· 11 小时前AI 评分22
Borzoi-SE:直接从DNA序列解码超级增强子调控语法与致病功能获得性变异
Decoding super-enhancer regulatory grammar and pathogenic gain-of-function variants directly from DNA sequence
AI 导读
研究人员开发了基于基因组Transformer Borzoi的深度学习框架Borzoi-SE,可直接从长序列中识别超级增强子,覆盖90种人类细胞谱系。该模型在β-globin超级增强子中锁定HS2为核心组分并经CRISPRi验证,还在CHRM2位点识别出一个创建GR基序、成核心脏超级增强子的单核苷酸变异,与静息心率和PR间期变异相关。
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