bioRxiv 预印本· Mendoza-Parra, M. A., Galindo-Albarra, A., Duvina, M., Barbao, P., Rodriguez-Garcia, A., Guedan, S., Heuser-Loy, C., Gattinoni, L. ·· 1 天前AI 评分18
SCITRAM:用于预测主转录因子的单细胞整合转录调控建模工具
SCITRAM: a Single-cell Integrated transcription regulation modeler for predicting master transcription factors
AI 导读
SCITRAM 是一款独立、易用的计算工具,可从单细胞转录组数据预测主转录因子:先重建初级基因调控网络,再以此为模板模拟转录因子激活驱动的转录级联。研究在实体瘤治疗中的 T 细胞耗竭、胰腺内分泌发生中的谱系分化及脑类器官神经组织形成等细胞命运转变事件中验证了其性能。该工具无需命令行环境即可处理大规模单细胞转录组数据。
来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org