bioRxiv 预印本· Li, Y., Jing, Y., Su, Y., Ren, W., Zhang, J., Liu, T. ·· 19 小时前精选AI 评分52
CheMoDesign:在扩展化学空间中从头设计蛋白质
De novo protein design in an expanded chemical space
AI 导读
bioRxiv 预印本提出生成式框架 CheMoDesign,可在用户指定化学结构周围从头设计蛋白质,将翻译后修饰、合成残基和化学修饰作为设计单元。该框架在单轮实验中生成具有化学依赖性识别与反应活性的蛋白:磺基酪氨酸和硝基酪氨酸分别实现对凝血酶的修饰依赖性识别和对 HER2 的识别,基因编码非经典残基实现生物正交亲和切换及光或邻近触发的共价靶标捕获。
推荐理由
该预印本提出把化学修饰纳入从头蛋白设计的生成框架,并给出针对凝血酶、HER2、PD-L1等靶点的单轮实验验证结果。
来源:bioRxiv 预印本 · biorxiv.org