bioRxiv 预印本· Jacobsen, C. P., Deweid, L., Birnbaum, F., Gormsen, L. W., Fryer, T., Jagd, U., Hald, A., Rasch, M. G., Jenkins, T., Ovchinnikov, S. ·· 1 天前AI 评分42
Proton-PottsMPNN：显式建模质子化状态的pH敏感结合体设计模型
pH-sensitive binder design with Proton-PottsMPNN
AI 导读
研究者提出序列设计模型Proton-PottsMPNN，将组氨酸、天冬氨酸和谷氨酸的质子化与去质子化状态作为独立序列token显式表示，从而围绕可滴定残基重塑微环境。基于该模型从头设计并合成展示于酵母的8,407个PD-L1候选结合体，经不同pH下FACS与MACS筛选分别获得237和288个独特pH依赖设计，转变pH跨4.0至5.8。
来源：bioRxiv 预印本 · biorxiv.org